计算生物学博士职位

Doctorant F/H Adnalyser de la population d’ARN axonaux dans le cerveau de la drosophile par transcriptomie spatiale

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The offer description be low is in French

Contract type : Fixed-term contract

Level of qualifications required : Graduate degree or equivalent

Fonction : PhD Position

Level of experience : Recently graduated

About the research centre or Inria department

L’Inria est l’Institut national de recherche en sciences du numérique, dont le centre Inria d’Université Côte d’Azur fait partie. Avec une forte expertise en informatique et mathématiques appliquées, les projets de recherche du centre Inria d’Université Côte d’Azur touchent toutes les dimensions des sciences et technologies du numérique, et génèrent de l’innovation. Implanté principalement à Sophia Antipolis, mais également à Nice ou Montpellier, il regroupe 47 équipes de recherche et neuf services d’appui. Il est présent dans les domaines de l’intelligence artificielle, la science des données, la sécurité des systèmes informatiques, la robotique, l’ingénierie de réseaux, la prévention des risques naturels, la transition écologique, la biologie numérique, les neurosciences computationnelles, les données de santé… Le Centre Inria d’Université Côte d’Azur est un acteur majeur en termes d'excellence scientifique par les résultats obtenus et les collaborations tant au niveau européen qu'international.

Context

Dans le cadre d’un partenariat public avec ANR.

L’ objectif est de développer un algorithme de recalage et d'analyse de données de transcriptomie spatiale plus particulièrement dédié à l'analyse de population neuronale dans la drosophile.

Assignment

Collaboration : La personne recrutée sera en lien avec une équipe de l'institut de biologie de Valrose et une équipe de l'IPMC.

Responsabilités : La personne recrutée a la charge du choix de l'algorithme, du développement du logiciel et de sa validation.

Main activities

Principales activés :

• Proposer des solutions algrotihmique pour le recalage 2D vers 3D

• Développer les logiciels

• Valider les logiciels sur les données fournies par les partenaires de l'IBV et de l'IPMC.

• Rédiger des articles

Skills

Compétences techniques et niveau requis :

• Niveau M2

• Langage Python.

• Analyse d'image.

• Une appétance pour la biologie est appréciée

• Langues : anglais

Benefits package

• Restauration subventionnée

• Transports publics remboursés partiellement

• Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)

• Possibilité de télétravail (après 6 mois d'ancienneté) et aménagement du temps de travail

• Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)

• Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)

• Accès à la formation professionnelle

• Sécurité sociale

Remuneration

Durée: 36 mois Localisation: Sophia Antipolis, France Rémunération brute mensuelle : 2300€

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General Information

• Theme/Domain : Computational Biology

Biologie et santé, Sciences de la vie et de la terre (BAP A)

• Town/city : Sophia Antipolis

• Inria Center :

Centre Inria d'Université Côte d'Azur

• Starting date : 2026-11-01

• Duration of contract : 3 years

• Deadline to apply : 2026-10-11

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Instruction to apply

Defence Security :

This position is likely to be situated in a restricted area (ZRR), as defined in Decree No. 2011-1425 relating to the protection of national scientific and technical potential (PPST).Authorisation to enter an area is granted by the director of the unit, following a favourable Ministerial decision, as defined in the decree of 3 July 2012 relating to the PPST. An unfavourable Ministerial decision in respect of a position situated in a ZRR would result in the cancellation of the appointment.

Recruitment Policy :

As part of its diversity policy, all Inria positions are accessible to people with disabilities.

Contacts

• Inria Team :

MORPHEME

• PhD Supervisor :

Descombes Xavier / Xavier.Descombes@inria.fr

About Inria

Inria, the French national institute for research in digital science and technology, supports the French government in national research and innovation strategies in the digital field, acting as Digital Programs Agency. Inria leads over 300 research and innovation projects with its 3,500 scientists, engineers, and support staff, in partnership with universities and the digital ecosystem (businesses, entrepreneurs, and public stakeholders). Together, we explore strategic fields such as artificial intelligence, cybersecurity, quantum computing, cloud technologies, digital transformation in healthcare, digital twins, and digital technologies for defence. We develop practical solutions such as software, tech startups, partnerships with national companies, and cutting-edge training programmes. Our goal is to drive scientific, technological, and industrial excellence to ensure France’s digital sovereignty.